Kayıtlar

Şubat, 2019 tarihine ait yayınlar gösteriliyor

Galaxy ile Genomik Veri Bilimi

Resim
Biyoloji ve genetik, veri açısından oldukça yoğun bilim dalları olmaları   sebebiyle istatistiksel ve bilişimsel metotlar çokça kullanılmaktadır. Bu metotların başka araştırmacılar tarafından da ulaşılabilir olması ve yapılan bilişimsel araştırmaların   tekrarlanabilirliği önemlidir. Tekrarlanabilirlik, bir çalışmada yapılmış olan analizlerin detaylı bir şekilde tanımlanması ve başka bir araştırmacı tarafından başka bir ortamda gerçekleştirilebilmesidir. Böylece bir araştırmacı, bir veri seti kullanarak başka bir araştırmacının farklı bir veri setiyle yapmış olduğu araştırmayı tekrarlayabilir. Maalesef çoğu yayımlanmış olan analizler tekrarlanabilir değildir. Bunun sebebi ise yazılım, parametre, kullanılan programların versiyonu hakkında bilgilerin eksik olmasıdır. Galaxy Platformuna Giriş Galaxy, genomik için erişilebilir bir analiz sistemidir. Galaxy herkes için ücretsiz olan bir web servisidir ( https://usegalaxy.org/  ). Birçok araç bulundurur, kalıcı olarak veri depo