İLETİŞİM

E-posta: biyoinformatikdunyasi@gmail.com
Web adresi: www.biyoinformatikdunyasi.blogspot.com

Yorumlar

Yorum Gönder

Bu blogdaki popüler yayınlar

NCBI ve BLAST ' a Giriş

Resim
NCBI Bir önceki yazımızda bahsetmiş olduğumuz veri tabanlarından biri olan NCBI (National Center for Biotechnology Information), hesaplama biyolojisinde araştırma yapan, genom verilerini analiz etmek için yazılım araçları geliştiren ve biyomedikal bilgiyi yayan, NLM (National Library of Medicine)’nin alt birimidir. 1988 yılında ABD’ de kurulmuştur. NCBI, matematiksel ve bilişimsel yöntemler kullanarak, moleküler seviyede temel biyomedikal alanlardaki problemler üzerine araştırmalar için rehberlik yapar.   Makale, gen, protein, nükleotid gibi farklı veri tabanları içerir. Bu veri tabanları sayesinde, literatür tarama, sekans araştırması yapma, farklı organizmalara ait genetik bilgiyi araştırma vb. bir çok alanda araştırmacılara kaynak sağlar. Öne çıkan popüler kaynaklar şöyledir; PubMed : MEDLINE (Medical Literature, Analysis, and Retrieval System Online)’ da 24 milyondan fazla alıntıya erişim sağlayan National Library of Medicine (NLM) ve diğer ilgili veri taba
Devamı

İnsan Genom Projesi

Resim
İnsan Genomu Hakkında Vücudumuz yaklaşık olarak yüz trilyon hücreden oluşmuştur. Her bir hücrenin içinde çekirdek, çekirdeğin içinde ise genetik bilginin tamamını içeren kromozomlar vardır. İnsan vücudundaki her hücrede 46 kromozom bulunur. 46 kromozom, 23 çift olacak şekilde gruplaşmıştır. Bu çift gruplarındaki kromozomlardan biri annemizden diğeri ise babamızdan gelir. İlk 22 kromozom çifti kadınlarda ve erkeklerde aynıdır ve 1 den 22 ye kadar numaralandırılır. Son kromozom çifti ise cinsiyeti belirleyen kromozomlardır. Erkeklerde bir büyük X ve bir küçük Y kromozomu, kadınlarda ise iki büyük X kromozomu bulunur. Her gen kromozomda belirli bir lokasyondadır. Genlerin DNA zincirinde bulunduğundan bir önceki yazımızda bahsetmiştik. DNA nın içeriğine bakacak olursak; DNA dört farklı kimyasal bazdan oluşur. Bunlar; adenin(A), timin(T), guanin(G) ve sitozin(C) dir. Bu bazlar genom boyunca milyarlarca kere tekrarlanarak DNA yı
Devamı

Biyoinformatikte Veri Tabanları

Resim
Veri Tabanı  Nedir?      Veri tabanı, verilerin sistematik bir şekilde toplanmasıyla oluşan, verinin depolanmasını ve üzerinde değişiklikler yapılmasını sağlayan elektronik bir bilgisayar sistemidir. Veri tabanları, herhangi bir verinin kolayca elde edilmesi konusunda ve aynı zamanda bir verinin değiştirilerek güncel bir yapı haline getirilmesinde yardımcı olurlar. Basit bir örnek verecek olursak; bir telefon rehberine kişilere ait isimleri  ve telefon numaralarını kaydetmek için bir veri tabanı kullanmak gerekir. Veri tabanları bilgilerin düzenli bir şekilde depolanması için önemlidir. Farklı kullanıcılar tarafından erişilebilirlerdir. Biyoinformatik Alanında Veri Tabanları Biyoinformatik alanı, çalışma alanı itibariyle biyolojik bilgilerin oluşturulması ve bu oluşturulan bilgilerin düzenli bir biçimde saklanması için veri tabanlarına ihtiyaç duyar. Biyolojik veriler, oldukça yoğun olduğundan dolayı haliyle bir veri tabanına -sistematik ve düzenli bir şekilde çalışmak
Devamı