Kayıtlar

Derin Öğrenme

-
Resim
Merhabalar sevgili takipçilerimiz, Bir önceki yazımızda makine öğrenmesi fonksiyonları, kullanım alanları ve çeşitli detaylarına değinmiştik. Bu yazımızda son zamanlarda makine öğrenmesinden daha fazla önem kazanan derin öğrenme kavramından bahsedeceğiz. Yapay zeka adıyla çıkılan yolda, gün geçtikçe farklı algoritmalar ve kavramlar meydana çıktı. Bununla birlikte problemlere daha detaylı yaklaşma amacıyla, az hata payı ile daha büyük verilerin analizini hızlandırılmış şekilde yapma ihtiyacı doğdu. Bu serüvenin en başında yapay zekadan sonra makine öğrenmesi kavramının bu alanda nasıl geliştirildiğinden ve hemen hemen işlenebilir çoğu veriyi bilgisayar ortamında anlamlandırma konusunda çeşitli algoritmalar kullanıldığından önceki yazımızda bahsetmiştik. Yeni yöntemlerin gelişmesi ve verinin büyümesiyle makine öğrenmesinin yeterli olmadığı düşünülmeye başlandı. Bu sebeple son zamanlarda derin öğrenme kavramına olan ilgi oldukça arttı ve çok sık duymaya başladık. Bazı kayn
1 yorum
Devamı

Yapay Zeka ve Makine Öğrenmesi Algoritmaları

-
Resim
Herkese yeniden merhaba sevgili okuyucularımız, Bu yazımızda, çoğunlukla algoritmalar olmak üzere, günümüzde yapay zekanın öneminden bahsedeceğiz. Artificial intelligence (AI), Türkçe “yapay zeka” , internet tarafından mümkün kılınan ve yakında günlük yaşamlarımız üzerinde önemli etkileri olabilecek hızla ilerleyen bir teknolojidir. Yapay zeka geleneksel olarak doğal dili öğrenebilen, akıllandırabilen, planlayabilen, algılayabilen veya işleyebilen insan benzeri zekanın yapay bir şekilde bilgisayar sistemleri üzerinde oluşturulmasını ifade eder. Daha basit manada anlatacak olursak, yapay zekanın amacı,   aslında insanı taklit ederek, insan zekasına benzer bir yapıyla üretimler geliştirmek, sorunlara çözümler üretmek ve gelişimler elde etmektir. Bilgisayar sistemleri bizden farklı olarak büyük verileri analiz etme, analitik hesaplamaları hızlı bir şekilde yapma ve hafıza konusunda güçlü bir yapıya sahip olma özelliklerine sahiptir. Bu nedenle, veri analizinde hızlı bir şekilde il
1 yorum
Devamı

Makine Öğrenmesi ve Biyoinformatik Alanında Kullanımı

-
Resim
Herkese merhaba sevgili okuyucularımız, Uzun bir aradan sonra “Makine Öğrenmesi ve Biyoinformatik Alanında Kullanımı” adlı yazımızla bilgi paylaşmaya devam ediyoruz. Bloğumuzda şu zamana dek genelde daha çok biyoloji ve genetik tabanlı yazılara yer vermiştik. Şimdi ise biraz daha işin bilgisayar ile ilgili olan kısmına giriş yapalım istiyoruz. Çünkü sizlerin de bildiği gibi, biyoinformatik denilince akla yalnızca genetik, biyoloji, genler, proteinler vs. gelmiyor. Bu alanın ilişkili olduğu daha birçok bilim dalı var, örneğin; enformatik, matematik, bilgisayar mühendisliği, veri madenciliği, yazılım vs. Öncelikle makine öğrenmesi nedir, türleri nedir gibi genel noktalara değinelim. Makine Öğrenmesi Tanımı Makine öğrenmesi yapay zekanın bir alt alanıdır. Bilgi teknoloji sistemlerinin veri tabanlarındaki örüntüleri tanıyarak sorunlara bağımsız olarak çözüm bulma yeteneğini ifade eder. Başka bir deyişle; makine öğrenmesi, bilgi teknoloji sistemlerinin mevcut algoritmalar ve veri k
1 yorum
Devamı

ExPASy: Protein Bilgileri için Temel İnternet Sitesi

-
Resim
Merhabalar sevgili okuyucularımız; Bildiğiniz gibi bir önceki yazımızda, sizlerle PubMed’ in nasıl kullanılacağına dair bazı bilgiler paylaşmıştık ve dUTPase adlı proteini örnek alarak, bir protein hakkında genel bilgilere nasıl ulaşılır öğrenmiştik. Şimdi de bir proteine dair daha detaylı bilgiler elde etmek adına sizleri ExPASy adlı internet sitesiyle tanıştıracağız. ExPASy, protein biyoinformatiğinin öncülerinden Prof. Amos Bairoch tarafından üretilmiş ve yönetilmekte olan ve tüm dünyada proteinlere dair lider bilgi kaynağı sağlayan bir internet sitesidir. ExPASy, Swiss-Prot protein dizisi veritabanına ek olarak kullanıcılara birçok sayıda farklı analiz aracı sağlar. Ayrıca farklı sunucularda daha özelleşmiş analizler yapmak için çok çeşitli dış bağlantılar sağlar. ExPASy’ de Bir Örnek E.coli bilindiği üzere araştırmalarda sıkça kullanılan bir organizmadır. Biz de bu örneğimizde E.coli bakterisini kullanarak, dUTPase fonksiyonunu gösteren proteinin dizisini bulmaya çalışac
Yorum Gönder
Devamı

PubMed

-
Resim
PubMed Nedir, Ne İşe Yarar, Nasıl Kullanılır? Merhaba değerli okuyucularımız, Bu yazımızda daha önce tanımlamasını yapmış olduğumuz NCBI bünyesinde bulunan önemli bir arama servisi olan PubMed hakkında bilgiler vereceğiz. PubMed nasıl kullanılır, bir makale, kitap veya her hangi bir kaynağa nasıl erişim sağlanır, PubMed de arama nasıl yapılır gibi birçok soruya cevap bulacağınız bir yazı olmasını ümit ediyoruz. PubMed Nedir? Öncelikle ufak bir hatırlatma olması açısından PubMed ile ilgili bilgilerimizi tazeleyelim. PubMed, ücretsiz bir kaynak olmakla birlikte, NLM (National Library of Medicine) gibi önemli veri tabanlarına erişim sağlayan bir arama servisidir. Bilimsel her hangi bir makalenin tamamı PubMed kullanılarak, yazarların da izin vermesi halinde kolayca erişilebilir. Böylelikle araştırmak istediğiniz konuya yönelik kaynaklara rahatça ulaşabilirsiniz. Bir Protein Hakkında İsmini Kullanarak Bilgi Edinmek Birkaç varsayımla işe başlayalım. Örneğin, uzun yıllardır
Yorum Gönder
Devamı

DNA Dizileme Yöntemleri - 2

-
Resim
DNA Dizileme Yöntemleri-2 Bu yazımızda 2006 yılından itibaren geliştirilmekte olan farklı DNA dizileme yöntemlerine uzun bir aradan sonra devam ediyoruz. İlk yeni nesil dizileme, 454 Pyrosequencing 2005 yılında Roche firması tarafından geliştirildikten sonra, farklı firmalar daha az maliyette daha iyi bir sonuca ulaşmak amacıyla yeni nesil dizileme metotlarını geliştirmekte rekabet içine girdiler. Firmalar tarafında hedeflenen dizileme maliyeti 1000$ olarak belirlendi. Böylelikle dizileme metotlarının dünya çapında daha çok kullanılması amaçlandı. Illumina Genome Analyzer Illumina 1998 yılında Amerika’da kurulmuş olan, biyolojik verilerin analizi, genetik bilginin işlenmesi gibi birçok alanda ürün geliştiren ve pazarlayan bir firmadır.   Illumina 2006 yılında geliştirdiği Genome Analyzer 2006 yılında Genome Analyzer isimli ilk SOLEXA dizileme metodunu geliştirdi. Bu cihaz önceki yöntemlere göre popülaritesi çok yüksek olan bir cihazdır çünkü bir çalıştırmada 1 gigabazlı
1 yorum
Devamı